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ERCSB NEWS

김완규 교수, 시스템 생명 정보 분석 기반 웹 분석 툴 논문 게재 (2/12, 3/4)
2019-03-13 13:30 written by admin (2021-01-21 16:30 Modify)
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이화 시스템 생물학 연구소 김완규 교수 연구팀이 시스템 생물학적 관점을 바탕으로 대규모 생명 정보를 분석하여 항암제 내성 기전과 약물의 작용 메커니즘 해석을 도와주는 웹 툴(CDRgator, CSgator)을 개발하고 관련 분야의 학술지에 논문을 발표하였다.

 

 

 

김완규 교수와 강승민 박사 그리고 장수경 석사 과정 학생이 항암제 내성 발생 메커니즘의 이해를 위해 약물 내성을 갖는 암세포주의 전사체를 종합적으로 분석하는 CDRgator(Cancer Drug Resistance navigator) 웹 툴을 개발하였다. CDRgatorGEOArrayExpress에서 개별적인 약물 내성 시그니처와 CTRPCCLE에서 약물 내성을 갖는 그룹의 시그니처를 분석하였으며 총 37개의 항암제에 대하여 603개의 항암제 내성 시그니처를 제공하고 있다.


본 논문은 Molecules and Cells (Impact Factor = 3.077)2019212일자 온라인에 게재되었다.

논문 URL:http://www.molcells.org/journal/download_pdf.php?doi=10.14348/molcells.2018.0413

 

 

또한, 김완규 교수와 박세라 박사 과정 학생이 약물 작용 메커니즘과 약물 타겟에 대한 이해를 위해 화합물과 연관된 타겟, 생체 활성, 질병, 구조를 종합적으로 분석하는 CSgator(Compound Set navigator) 웹 툴을 개발했다. CSgator는 약 9,000만 개의 화합물에 대한 타겟 정보(300만 건), 생체 활성(23,000만 건), 질병 정보(160만 건)를 제공하고 있다.


본 논문은 Journal of Cheminformatics (Impact Factor = 3.893)201934일자 온라인에 게재되었다.

논문 URL : https://jcheminf.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13321-019-0339-6#Bib1

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Comments(8)

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